预防污染很重要，也是必须要做的，但是一旦出现污染，也要能够较早的判断出污染原因，才能够尽快调整，避免连续性的污染而出现较大的损失。
污染的过程，就是微生物侵染菌包的过程，微生物是摸不着、看不见的，所以很多时候确定污染原因是很难的，本文从四个方向进行分析判断污染原因。
一、从规律上判断
1、与灭菌锅有关联
污染的菌包出现在某一个（某一次）灭菌锅灭菌的菌包中，也就是污染的规律是和灭菌不彻底有关联。
2、与栽培种有关联
污染的菌包出现在某一个批次的栽培种中，也就是污染的规律是和某一个批次的菌种不合格有关联。
3、与培养室（棚）有关联
污染的菌包出现在某一个培养室（棚），也就是污染的规律和培养环境有关联。
4、与季节有关联
污染的菌包出现在某一个季节，也就是污染的规律是和不同季节的不同温度湿度有关联。
5、与接种机（人）有关联
污染的菌包出现在某一个接种机（人）接种的菌包中，也就是和接种机（人）的操作有关联。
类似的规律性还有很多，更有很多细节性的规律，这里就不一一列举了，当出现污染时，能否找到这些规律是判断污染原因的重要依据，规律性的判断更为直接，准确，有说服力。
有的时候污染是没有规律的，实际上没有规律也是一种规律，一般是污染的环节较多和环境导致的污染。
二、从数量上判断
数量较少，又没有规律性的污染原因，很多时候很难准确的确定，但是导致数量较多的污染主要是以下几个原因。
1、灭菌不彻底，灭菌温度和时间不符合要求。
2、栽培种质量不合格、污染、高温培养、老化、运输等。
3、接种环境消毒不彻底。
4、封口方式不合理，没有很好的过滤和保护的作用。
5、培养环境高温、高湿。
6、培养环境消毒不彻底，杂菌含量较高，或者污染菌包的再次扩散传播
从数量上判断污染原因，不是非常准确，还要结合其他几点进行判断。
三、从污染时间和染菌部位上判断
在接种以后，每天进行仔细的观察，及时发现污染表现出来的时间，并结合染菌部位，对于确定污染原因非常重要，也是比较可靠的一种判断方法。
1、接种后24-48小时
在菌种本身上萌发出杂菌，通常是青霉菌、绿霉菌等霉菌，基本可以确定是栽培种导致的污染。
2、接种后5天以内
在菌种的一部分（占比较小），或者菌种附近，料面，中孔出现的杂菌，可以考虑是接种导致的污染，一般也是霉菌。
3、接种后5天以内
在菌包的不同位置，没有规律性，分散性的出现杂菌萌发点，而且数量较多，要考虑是灭菌不彻底导致的污染，一般也是霉菌污染。
4、接种后5天以后
在料面，在正常萌发的菌种菌丝表面出现杂菌，考虑是培养环境不好和高温、高湿导致的污染。
在菌包四周，出现的点状霉菌污染，考虑是微孔导致的污染，也和培养环境有一定的关系。
四、从污染杂菌种类判断
1、细菌污染
在固体菌种生产的工艺中，导致细菌污染的原因并不多，主要是灭菌、栽培种、培养环境高温、培养基含水量过高。
2、霉菌污染
霉菌污染，如果生产不正常，就按照上面的方法进行判断，几乎每一个环节都会导致霉菌污染。
如果生产正常，生产较为规范，就可以排除灭菌、接种、栽培种等基本的流程，那就主要考虑环境了，厂区和车间的环境消毒要加强。
3、红色链孢霉污染
红色链孢霉也是一种霉菌，除了上面的判断方法以外，重点要考虑环境消毒、高温、高湿、污染菌包的二次传播。
食用菌生产比较复杂，污染原因也是多种多样，以上判断方法不可能百分百准确，切勿完全照搬，要理解原理，根据实际情况灵活的运用。
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