母种，因为通常是用试管制作的，所以也叫做试管种，它是最早一级的菌种，所以也叫一级种。
母种的封口方式有两种：棉塞和硅胶塞。
在没有硅胶塞，或者一些好氧型品种，只能使用棉塞封口。
在制作棉塞时，经常出现以下错误：
1、使用脱脂棉制作棉塞
正确的做法：普通纯棉花
脱脂棉制作的棉塞，在灭菌的过程中受潮后，不容易烘干，母种接种后，棉塞容易引起污染。普通棉花的滤菌效果也比脱脂棉好。
2、过松或者过紧
正确的做法：松紧适中
母种棉塞过松，在灭菌和培养时容易脱落，对过滤效果也有影响；过紧，透气性受到影响，导致好氧型品种生长速度慢。
3、棉塞受潮
正确的做法：烘干棉塞
灭菌后，把灭菌锅盖打开一个缝隙，利用灭菌锅的余温，烘干棉塞，时间15-30min。
在食用菌生产中，一支生产母种可能导致几万袋（瓶）污染，继代母种带来的影响更大，做好母种是食用菌生产的前提，做好母种棉塞是做好母种的前提，是基础中的基础，不容忽视！
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