在固体菌种生产工艺下，栽培种的用量是最大的一级菌种，栽培种纯度和质量，直接影响到菌包的污染率和发菌状态，因此栽培种在食用菌生产中起着举足轻重的作用，就好比是种植业中种子。
1、保证原种的纯度
栽培种是由原种转接而来的，原种的纯度对栽培种的纯度产生直接的影响，尽量自己制作原种，如果需要购买原种，在运输的过程中注意避免高温，购买回来的菌种不要长时间存放，尽快使用。
2、熟料灭菌
栽培种一定要用熟料制作，不要使用发酵料、发酵熟料，熟料灭菌能够保证灭菌完全彻底，有条件的朋友最好采用高压灭菌。
3、精细化接种
栽培种要使用接种箱、接种室进行接种，尽量使用层流罩、净化室接种，精细化接种能够有效降低染菌率。
4、适温、恒温、避光
栽培种要在装有控温装置的培养房发菌，特别是在夏季，温度过高，菌丝生长速度过快，菌丝纤弱，虽然看起来菌丝也是白的，但是接到出菇包后萌发慢，活性差。
5、及时挑杂
即使在工厂化生产中，栽培种也是会有一定的污染率，栽培种的杂菌挑出标准比较严格，看起来有一点不正常就要挑出来，如果单个批次的栽培种污染率过高，整批弃用。
6、小袋制作
栽培种一定要使用小袋制作，通常是15cm×28cm或17cm×33cm的折角袋，小袋生长速度快，菌龄短，污染少，活性强。
7、合适的含水量
出菇袋需要给子实体提供充足的水分，而栽培种则不需要很高的含水量，通常60-63%的含水量比较合适。
8、做好生产计划
要按年度为单位，做好菌种生产计划，做到有计划生产，有计划使用，保证使用的是刚刚长好的栽培种。
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